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仪器数据采集在 LIMS 建设过程中,主要目标是实现从 LIMS 中将样品编号,检验检测项目、方法等发送到仪器设备工作站,并从仪器设备工作站中将样品编号,检验检测项目、方法、结果,质控结果等信息发送到 LIMS中,从而实现双方向的数据自动传输。仪器设备的数据采集是 LIMS 能够极大提升检验检测人员效率的功能,因此是否进行了仪器采集、仪器采集覆盖实验室的仪器数量、是否进行双向传输等经常作为 LIMS 提升效率的关键评判标准。
根据仪器是否具备双向传输条件,将仪器数据采集划分为双向传输仪器数据采集和单向传输仪器数据采集。
要实现双向传输,主要有两种方式；
一种是通过与网络化色谱工作站(如:Empower,CDS等)集成进行双向传输；
另一种是直接通过仪器设备提供的接口的议进行数据传输。根据仪器设备提供的数据传输接口、工作站的情况等,将仪器数据采集划分为串口数据采集,并口仪器数据采集、网口仪器数据采集、蓝牙仪器数据采集、文件仪器数据采集等不同的种类。但是,在 LIMS 建设过程中,为了达到仪器接口的统一性,一般会辅以硬件资源,将不同的接口转化为统一的接口方式,例如,将串口、并口、蓝牙等通过相应的转换器直接转换为统一的无线网络传输,这样在 L.IMS 中只需要针对网络传输协议进行数据处理即可。需要说明的是,为使数据在仪器和 LIMS 之间传输,需要将仪器产生的数据上网。但是考虑到实验室仪器直接接入互联网会造成潜在的安全风险,所以仅将仪器接入安全的局域网,同时要保证,仪器联网技术不能与仪器工作站的软件产生冲突。
所有数据统一存储于单机数据库, 关联人、机、料、法、环等信息 (如: 生产设备、产品批次、测量仪器等)，不能通过网络访问，只能通过本机计算机访问。 后期也可作为LIMS系统质量大数据平台的数据采集端使用，保证客户不会重复投入。
完成现场量具的配置连接，检验数据采集，统计分析CPK计算，检验记录追溯、查看等功能。
数据采集功能，数据采集工具将以客户端的形式运行在与设备连接的工作站电脑上，主要负责将设备产生的完整的可输出的原始结果提取到系统，供实验室人员进行报告生成，汇总等操作。
仪器数据采集采用系统+ActiveMQ消息服务器客户端的形式实现，数据采集分为两部分，第一可将需要的样本编号等信息以约定的形式发送给设备。 第二根据约定的采集规则进行设备结果的采集。
系统负责对需要进行数据采集的设备信息的记录以及采集规则的设置工作并且触发手动采集结果和向设备发送信息的动作。 采集后的数据由系统呈现。消息服务器负责实时的沟通系统与采集客户端，并对这两端的数据进行传递；
采集客户端负责进行实际的采集行为的处理，并将采集后的结果以消息的形式返回。采集客户端还负责将设备所需的项目编号等信息以约定的形式发送给。 设备采集时根据各设备情况可分为手动采集和自动采集，手动采集时由系统界面发起采集动作;
采集客户端实时监听采集申请，客户端收到采集申请后进行相应设备结果的数据采集然后以消息的形式返回给系统完成数据采集； 自动数据采集时由采集客户端根据本地配置的采集规则进行定时的结果扫描并将需要的数据回发给LIMS系统；
实验人员将分析仪器检测结果文件（如PDF、word、Excel、CSV、TXT ） 等从数据工作站中导出，存放至指定目录下，LIMS系统或者开发的采集数据软件。 定时扫描改文件夹，通过解析仪器的检测结果文件的数据存储格式，从文件中提取实验室结果信息存储至LIMS的检测结果数据库中
